Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Odf2A3KGV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf2A3KGV1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms