Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatsperbA2RTF1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms