Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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