Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lcn6A2AJB9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lcn6A2AJB9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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