Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms