Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp8nlA2ABX0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms