Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef6A2A8M8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pramef6A2A8M8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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