Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprfA2A8L5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms