Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prdm2A2A7B5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm2A2A7B5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms