Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calcoco2A2A6M5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms