Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam171a2A2A699 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms