Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc112A0AUP1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc112A0AUP1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms