Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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