Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv26A0A0B4J1P5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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