Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv15A0A0A6YYE3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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