Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NEUROD1Q13562 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms