Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
HMGN3Q15651 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 764.7 ms