Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TMPOP42166 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TMPOP42166 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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