Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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