Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
J3QKU1 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
J3QKU1 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms