Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ITGA9Q13797 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms