Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3238W4VSP7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms