Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms