Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Homer1Q9Z2Y3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms