Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms