Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccl8Q9Z121 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccl8Q9Z121 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms