Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmg20bQ9Z104 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms