Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup160Q9Z0W3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms