Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip2Q9Z0H8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms