Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PapolbQ9WVP6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms