Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf13bQ9WU72 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms