Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms