Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms