Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms