Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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