Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms