Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Six6Q9QZ28 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Six6Q9QZ28 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Six6Q9QZ28 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Six6Q9QZ28 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Six6Q9QZ28 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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