Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phtf1Q9QZ09 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms