Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms