Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxe3Q9QY14 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxe3Q9QY14 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms