Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2e3Q9QXZ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms