Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Limd1Q9QXD8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms