Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trpc5Q9QX29 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms