Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1eQ9JMK2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms