Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg4Q9JM99 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg4Q9JM99 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg4Q9JM99 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg4Q9JM99 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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