Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrfQ9JM73 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms