Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc4apQ9JLV2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms