Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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