Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms