Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnga3Q9JJZ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms